Lang niet alle leerlingen die van het praktijkonderwijs komen en die willen doorleren, worden toegelaten op de mbo-opleidingen. Ze worden bijvoorbeeld geweigerd omdat de school inschat dat jongeren het niveau niet aankunnen, of omdat de school denkt niet de juiste ondersteuning te kunnen bieden in het kader van passend onderwijs.
Een ander probleem is dat heel wat leerlingen die vanuit het praktijkonderwijs doorstromen naar een mbo-opleiding, voortijdig afhaken. Met als gevolg dat ze onvoorbereid de arbeidsmarkt opkomen. Hun kansen op werk waren vaak groter geweest als ze direct na een stage vanuit het praktijkonderwijs van school waren gegaan.
Dit probleem speelt al een tiental jaren, maar lijkt de laatste tijd tot meer ophef te leiden omdat onder andere vanwege de economische crisis het aantal beschikbare banen rond het minimumloon is afgenomen en omdat met de invoering van passend onderwijs mbo-scholen geen individuele 'rugzakjes' per student meer hebben (er is geen leerlinggebonden financiering meer).